dr hab. Kinga Kamieniarz-Gdula, Prof. UAM
Laboratorium Regulacji Genomu (STOP lab)
Zainteresowania badawcze
> regulacja ekspresji genów
> transkrypcja i procesowanie RNA
> chromatyna i epigenetyka
> genomika i transkryptomika
Adiunkci i stażyści podoktorscy
dr Joanna Kwiatkowska
mazur@amu.edu.pl
Pokój: A213
dr Agata Stępień
stepiena@amu.edu.pl
Pokój: A213
dr Upasana Saha
upasah@amu.edu.pl
Pokój: A223
Pracownicy techniczni
dr Martyna Plens-Gałąska
mp18932@amu.edu.pl
Pokój: A226
dr Ewa Stein
ewa.stein@amu.edu.pl
Pokój: A213
Doktoranci
Magda Kopczyńska
magkop5@amu.edu.pl
Pokój: A226
Deepshika Pulimamidi
deepul@amu.edu.pl
Pokój: A213
Apoorva Shrivastava
aposhr@amu.edu.pl
Pokój: A213
Klaudia Ostatek
klaudia.ostatek@amu.edu.pl
Pokój: A213
Inni pracownicy
Violetta Basczok
Referent (anioł ERC)
viorud1@amu.edu.pl
Aktualnie realizowane granty
ERC Starting Grant: 101042642 ‘AlternativeEnds’
„Alternative gene ends: the crosstalk of RNA cleavage and transcription termination”
ERC Proof of Concept Grant: ‘ModulatEnds
“Improving cancer therapy by identification of novel drug leads modulating transcription termination bridging molecular biology and therapeutic applications”
EMBO IG: 4728-2020
“EMBO Installation Grant”
MINIATURA: 2024/08/X/NZ1/00722
„Opracowanie metody opartej o fluorescencyjną hybrydyzację in situ do identyfikacji czynników odpowiedzialnych za wczesną terminację transkrypcji”
SONATA BIS: 2018/30/E/NZ1/00073
„Rola przedwczesnej terminacji transkrypcji w regulacji ekspresji genów u człowieka”
Wybrane publikacje
Defining gene ends: RNA polymerase II CTD threonine 4 phosphorylation marks transcription termination regions genome-wide, M. Kopczyńska, U. Saha, A. Romanenko , T. Nojima, M. R. Gdula, K. Kamieniarz-Gdula, J. Nucleic Acids Res., 2024, 53, gkae1240. [LINK⇒]
CLP1-dependent premature transcription termination opposes neurodegeneration, M.R. Gdula, M. Kopczyńska, U. Saha, K. Kamieniarz-Gdula, J. Neuron., 2022, 110, 1277 – 1280. [LINK⇒]
Transcriptional Control by Premature Termination: A Forgotten Mechanism, K. Kamieniarz-Gdula, N.J. Proudfoot, J. Trends Genet., 2019, 35, 533 – 564. [LINK⇒]
Selective Roles of Vertebrate PCF11 in Premature and Full-Length Transcript Termination, K. Kamieniarz-Gdula, M.R. Gdula, K. Panser, T. Nojima, J. Monks, J.R. Wiśniewski, J. Riepsaame, N. Brockdorff, A. Pauli, N.J. Proudfoot, J. Mol. Cell, 2019, 74, 158 – 172. [LINK⇒]
WNK1 kinase and the termination factor PCF11 connect nuclear mRNA export with transcription, A. Volanakis, K. Kamieniarz-Gdula, M. Schlackow, NJ Proudfoot, J. Genes Dev., 2017, 31, 2175 – 2185. [LINK⇒]
BRCA1 recruitment to transcriptional pause sites is required for R-loop-driven DNA damage repair, E. Hatchi, K. Skourti-Stathak, S. Ventz, L. Pinello, A. Yen, K. Kamieniarz-Gdula, S. Dimitrov, S. Pathania, K.M. McKinney, M.L. Eaton, M. Kellis, S.J. Hill, G. Parmigiani, N.J. Proudfoot, D.M. Livingston, J. Mol. Cell, 2015, 57, 636 – 647. [LINK⇒]
R-loops induce repressive chromatin marks over mammalian gene terminators, K. Skourti-Stathaki, K. Kamieniarz-Gdula, N.J. Proudfoot, J. Nature, 2014, 516, 436 – 439. [LINK⇒]
Human nuclear Dicer restricts the deleterious accumulation of endogenous double-stranded RNA, White E, Schlackow M, Kamieniarz-Gdula K, Proudfoot NJ, Gullerova M, Nat Struct Mol Biol. 2014, 21, 552-9. [LINK⇒]
Regulation of transcription through acetylation of H3K122 on the lateral surface of the histone octamer, Tropberger P, Pott S, Keller C, Kamieniarz-Gdula K, Caron M, Richter F, Li G, Mittler G, Liu ET, Bühler M, Margueron R, Schneider R., Cell., 2013, 152, 859-72. [LINK⇒]
The genomic landscape of the somatic linker histone subtypes H1.1 to H1.5 in human cells, A. Izzo, K. Kamieniarz-Gdula, F. Ramírez, N. Noureen, J. Kind, T. Manke, B. van Steensel, R. Schneider, J. Cell Rep., 2013, 3, 2142 – 2154. [LINK⇒]