Oferta pracowni
Laboratorium Cytometrii
Laboratorium znajduje zastosowanie głównie w dziedzinie biotechnologii medycznej i badaniach nad komórkami ssaków, a także w ocenie wpływu nowych leków i farmaceutyków na pojedyncze komórki w warunkach in vitro:
- sortowanie populacji komórek o pożądanych cechach, w tym sortowanie komórek barwionych barwnikami fluorescencyjnymi (FACS)
- analiza populacji komórek pod względem występowania określonych czynników, np. wprowadzonego białka fluorescencyjnego, markerów powierzchniowych, zawartości DNA
- określanie wielkości, granulacji i kształtu komórek zwierzęcych i innych
Laboratorium Bioobrazowania
Laboratorium znajduje szerokie zastosowanie w biologii komórkowej, biotechnologii, medycynie regeneracyjnej oraz farmakologii. Wykorzystywane jest do badania procesów molekularnych i morfologicznych w komórkach i tkankach. Techniki bioobrazowania wspierają rozwój nowych terapii, badania nad nowymi biomateriałami oraz analizę odpowiedzi komórkowych na leki w badaniach in vitro. Zakres badań Laboratorium Bioobrazowania obejmuje:
- analizę struktur komórkowych i tkankowych przy użyciu zaawansowanych technik mikroskopowych
- obrazowanie fluorescencyjne żywych komórek i tkanek w czasie rzeczywistym
- badanie dynamiki procesów biologicznych oraz interakcji międzykomórkowych
- monitorowanie odpowiedzi komórek na bodźce zewnętrzne, analizę lokalizacji i aktywności białek
- badanie struktur subkomórkowych
Laboratorium Biologii Molekularnej
Badania realizowane w ramach Laboratorium znajdują zastosowanie w obszarze biotechnologii medycznej i tworzeniu nowych białek terapeutycznych, ale także w innych dziedzinach jak ochrona środowiska czy przemysł przetwórczy oparty o wykorzystanie mikroorganizmów:
- badanie i izolacja genów kodujących pożądane cechy
- opracowywanie systemów wprowadzania nowych genów do komórek
- tworzenie nowych szczepów bakteryjnych i kultur komórkowych produkujących cenne białka i peptydy
- optymalizacja i zwiększanie wydajności produkcji białek
Laboratorium Hodowli Komórek i Tkanek
Laboratorium Hodowli Komórek i Tkanek jest wyposażone w infrastrukturę pozwalającą na sterylną pracę z szerokim spektrum kultur komórkowych i tkankowych in vitro, w tym:
- prowadzenie hodowli kultur komórek zwierzęcych i ludzkich, w tym komórek macierzystych
- bieżące utrzymanie w hodowli linii komórek adherentnych i suspensyjnych, linii komórek ludzkich, zwierzęcych i zmodyfikowanych genetycznie (GMO).
- izolacja i hodowla komórek zwierzęcych
- transfekcja komórek
- badania nad działaniem hormonów, enzymów, nanocząstek i środków chemicznych in vitro
- badanie i produkcja przeciwciał, w tym przeciwciał monoklonalnych
- badanie i produkcja białek i peptydów
- badanie cytotoksyczności
Badania realizowane w Laboratorium znajdują szerokie zastosowanie w obszarze badań medycznych, badań przedklinicznych i biotechnologii medycznej, a także w przemyśle medycznym i diagnostyce.
Opiekunowie pracowni
dr Kamil Szeliski
kamil.szeliski@amu.edu.pl
Dostępna Aparatura
Cytometr przepływowy z sorterem SONY MA900
- wyposażony w 4 lasery wzbudzające: 405 nm, 488 nm, 561 nm i 638 nm w systemie 2 kolinearnym (488 nm + 561 nm, 405 nm + 638 nm)
- detekcja do 12 kanałów fluorescencyjnych oraz sygnałów z detektorów SSC i FSC w jednej analizie
- sortowanie 2- lub 4-drogowe do probówek (15 ml – 2-way / 5 ml – 4-way), na płytki wielodołkowe i płytki PCR
- szybkość sortowania do 12 000 eps (events per second, dla dyszy 70 µm)
- podawanie próbek z probówek 0.5 mL, 1.5 mL, 5 mL i 15 mL
- termostatowanie prób (5 – 37°C) i automatyczne mieszanie (300 rpm)
- wymienne, jednorazowe chipy sortujące o średnicy dyszy 70 µm, 100 µm i 130 µm (130 µm po wcześniejszych ustaleniach)
Cytometr przepływowy z sorterem Bio-Rad S3
- wyposażony w 2 lasery wzbudzające: 488 nm i 561 nm (100 mW)
- 4 detektory fluorescencji z PMT, detektory forward scatter (FSC) i side scatter (SSC)
- sortowanie 2 – drogowe do probówek 1.5 mL, 5 mL oraz na szkiełka podstawowe i probówki do PCR (8 – well strips)
- szybkość analizy do 100 000 eps (events per second), szybkość sortowania do 30 000 eps
- termostatowana komora próbki i komora sortująca (4 – 37°C)
- średnica dyszy 100 µm
Fluorescencyjny mikroskop biologiczny Olympus BX53
- metody obserwacji preparatów: jasne pole, ciemne pole, kontrast fazowy, światło spolaryzowane, fluorescencja
- filtry fluorescencyjne:
U-FUN (Ex 360-370 nm/Em 420 nm – DAPI, Alexa 350, 405, Hoechst 33258)
U-FVN (Ex 400-410 nm/Em 460 nm – ERTracker Blue-White)
U-FBN (Ex 470-495 nm/Em 510 nm –Alexa Fluor 488, Rhodamine 123)
U-FGNA (Ex 540-550 nm/Em 570 nm – TRITC, Rhodamine)
- oświetlacz Koehlera z lampą halogenową o dużej mocy
- źródło światła do fluorescencji – lampa rtęciowa
- kamera cyfrowa wraz z oprogramowaniem do analizy obrazów mikroskopowych Olympus cellSens
- okular 10x z regulacją dioptrii
- obiektywy 10x, 20x, 40x, 60x, 100x
Fluorescencyjny mikroskop biologiczny w układzie odwróconym Olympus IX73
- metody obserwacji preparatów: jasne pole, kontrast fazowy, fluorescencja
- filtry fluorescencyjne:
U-FUW (Ex 340-390 nm/Em 420 nm – DAPI, Alexa 350, 405, Hoechst 33258)
U-FBW (Ex 460-495 nm/Em 510 nm – Alexa Fluor 488, Rhodamine 123)
U-FGWA (Ex 530-550 nm/Em 570 nm –TRITC, Rhodamine –phalloidin)
U-FGW (Ex 530-550 nm/Em 575 nm – Cy3, Alexa 546, 555, 568, Propidium iodide (PI), Phycoerythrin, resorufin, TRITC)
- źródło światła do fluorescencji – lampa rtęciowa
- kamera cyfrowa wraz z oprogramowaniem do analizy obrazów mikroskopowych Olympus cellSens
- okular 10x z regulacją dioptrii
- obiektywy 4x, 10x, 20x, 40x, 60x
Mikroskop stereoskopowy Olympus SZX10
- głowica trinokularowa z kamerą cyfrową i oprogramowaniem Olympus cellsens
- oświetlacz halogenowy z ruchomym źródłem światła (światłowody) – obserwacja w świetle odbitym
- okular 10x
- obiektywy 0.5x, 1.0x, 2.0x
- zoom 0.63-6.3x
Mikroskop konfokalny Olympus FV1200 (oparty na odwróconym mikroskopie IX83)
Nowoczesny system skaningowego mikroskopu konfokalnego umożliwiający prowadzenie zaawansowanych badań biologicznych i materiałowych, zarówno na preparatach żywych, jak i utrwalonych:
- Wielodetekcyjna obserwacja preparatów żywych i utrwalonych.
- Zmotoryzowany stolik przedmiotowy XYZ umożliwiający precyzyjne pozycjonowanie próbek.
- Kompensacja dryfu termicznego w osi Z, dzięki czemu długotrwałe obserwacje są stabilne i powtarzalne.
- System kompensacji ostrości (Perfect Focus System – PFS) do automatycznej korekty zmian ogniskowania podczas długich pomiarów.
- Skanowanie różnych obszarów ROI – m.in. dla technik FRAP, FLIP, FRET i fotopobudzeń.
- Szybkość skanowania do 4 ramek/sekundę (512 x 512 px).
- Możliwość uzyskania obrazów do 2048 x 2048 px, w 12-bitowej skali szarości.
Źródła wzbudzenia (lasery):
- 405 nm (25 mW, dioda fioletowa),
- 458/473/488/515 nm (niebieskie, zielone),
- 559 nm (zielony DPSS),
- 635 nm (czerwony diodowy, 25 mW).
Detektory:
- Dwa detektory GaAsP o wysokiej czułości – idealne do słabych sygnałów fluorescencyjnych.
- Trzy detektory PMT z możliwością regulacji pasma detekcji dzięki systemowi galvo.
- Możliwość równoczesnej detekcji do 5 kanałów fluorescencji.
- Opcjonalny detektor światła transmitowanego.
Tryby obrazowania i eksperymenty specjalne:
- Zobrazowania 3D (w osi XYZ) z wysoką gęstością danych.
- Skanowanie liniowe, punktowe, lambda (widmowe), czasowe (xyzt).
- FRAP, FLIP, FRET – umożliwione dzięki precyzyjnemu wybieraniu ROI i modulacji wiązki.
- Techniki korelacyjne: FCS, FCCS, RICS.
- Rejestracja zmian fluorescencji w czasie (time-lapse imaging).
Obiektywy mikroskopowe (UPLSAPO):
- Obiektywy silikonowe i wodne (immersyjne) zapewniające głębokie obrazowanie w grubszych tkankach.
- 10x / NA 0.40
- 20x / NA 0.75
- 40x / NA 1.05 (immersja silikonowa)
- 60x / NA 1.3 i 1.4 (immersja silikonowa i olejowa)
Termocyklery Applied Biosystems ProFlex 3×32 well
- trzy niezależnie programowalne bloki grzewcze 32 x 0.2 mL
- wymienne bloki – możliwość zmiany wykorzystywanych probówek PCR
- predefiniowane programy reakcji PCR
- możliwość tworzenia programów Użytkownika
- możliwość symulacji programów temperaturowych starszych systemów do PCR (Eppendorf, Bio-Rad, Applied Biosystems)
Termocykler qPCR -Applied Biosystems QuantStudio 6 Flex Real-Time PCR System
- system wyposażony w blok grzewczy 384-dołkowy, z możliwością wymiany (96 dołków)
- kompatybilność z systemem TaqMan, SYBR
- zakres temperatur od 4°C do 99°C, dokładność 0.25°C, przyrost temperatury do 6.5°C
- źródło światła wzbudzającego– lampa halogenowa
- detekcja 5 kolorów
System wizualizacji i archiwizacji membran i żeli Syngene G-BOX Chemi XR5
- system wyposażony w ciemnię i chłodzoną kamerę CCD 4 Mpx
- wbudowany transiluminator UV 302 nm
- oświetlenie LED dla wizualizacji żeli barwionych kolorymetrycznie (Silver Stain, Coomasie Brilliant Blue)
- rejestracja chemiluminescencji membran Western Blot
- możliwość wizualizacji najpopularniejszych barwników: EtBr, Safe Stains, SYBR
- oprogramowanie do zapisu i obróbki zdjęć Syngene GeneSys
Spektrofotometr mikrolitrowy Thermo Scientific NanoDrop 2000
- objętość próbki 0.5 – 2 µl
- zakres pomiarowy 190 – 840 nm
- pomiar absorbancji szerokiego zakresu prób: peptydów (205 nm), DNA/RNA (280 nm), białek (280 nm), reakcji kolorymetrycznych (BCA 562 nm, Bradford 595 nm, Lowry 650 nm, Pierce 660 nm), gęstości optycznej (600 nm)
- automatyczna optymalizacja długości drogi optycznej dla stężeń od 2 do 15 000 ng/µL dsDNA
- automatyczna kalkulacja czystości próbek (260/280 nm i 260/230 nm
Czytnik wielodetekcyjny Tecan Inifinte M200Pro
- odczyt prób na płytkach wielodołkowych (6 – 384)
- optyka oparta o monochromator lub filtry, pozwalająca na odczyt absorbancji, spektrum absorbancji, fluorescencji (top/bottom), luminescencji (glow, flash, multicolor), TRF, FRET, TR-FRET
- fluorescencja (Ex 230-850 nm, Em 280-850 nm), absorbancja (230-1000 nm)
- zastosowanie w wielu metodach pomiarowych: ELISA, stężenie DNA/RNA, stężenie białek (BCA, Bradford), pomiar ilości ATP, jonów Ca2+, Transcreen, Polarscreen, GeneBLAzer, DLR, BRET, HTRF, DELFIA
- termostat prób od +5°C do +42°C
- mieszanie prób przed pomiarem (liniowe, orbitalne)
- iniektor odczynników Te-Inject
- Gas Control Module – zapewnia optymalne warunki poziomu CO2 w długotrwałych pomiarach linii komórek eukariotycznych
Sonikator laboratoryjny Bandelin Sonoplus mini20
- moc maksymalna 20 W, częstotliwość 30 kHz
- objętość próbki od 0.25 do 25 mL (końcówki 1.5, 2.5 mm)
- sterowanie impulsowe 0.1 – 60 s
Homogenizator laboratoryjny Kinematica X120
- obroty 10 000 – 33 000 rpm
- głowice nożowe typu rotor-stator TM6 (2-50 mL), TM10 (10-250 mL), TM17 (250-1500 mL)
Systemy do elektroforezy w żelach agarozowych i poliakrylamidowych
- systemy do elektroforezy horyzontalnej C.B.S.Scientific
- systemy do elektroforezy horyzontalnej Kucharczyk
- systemy do elektroforezy w żelach poliakrylamidowych (PAA) Kucharczyk
Elektroporator laboratoryjny Bio-Rad GenePulser Xcell
- umożliwia transfekcję komórek prokariotycznych i eukariotycznych: bakterii, grzybów, drożdży, komórek macierzystych, komórek zwierzęcych
- kompatybilność z kuwetami Bio-Rad 0.1 cm, 0.2 cm i 0.4 cm
- kompatybilność ze wszystkimi buforami do elektroforezy
- możliwość korzystania z predefiniowanych protokołów oraz ustawień manualnych
- napięcie 10-3 000 V, rezystancja 50 – 1 000 Ohm
- rezystancja próbki min. 20 Ohm (10 – 2 500 V) lub 600 Ohm (2 500 – 3 000 Ohm)
Komory laminarne II klasy bezpieczeństwa biologicznego Faster SafeFast Classic 218
- II klasa bezpieczeństwa (wg EN-12469:2000)
- pionowy przepływ laminarny w całej objętości komory
- wyposażone w filtr wlotowy i wylotowy HEPA H14/ULPA (stosunek powietrza recyrkulowanego do wyrzucanego 70:30)
- blat roboczy o szerokości 180 cm ze stali nierdzewnej (304), demontowalny – możliwość sterylizacji w autoklawie
- szyba frontowa sterowana elektrycznie
- zintegrowane oświetlenie UV-C zapewniające dezynfekcję powierzchni roboczej i sprzętu
- wskaźnik prędkości liniowej przepływu laminarnego powietrza (LAF)
Komory laminarne II klasy bezpieczeństwa biologicznego Thermo Scientific Safe 2020 1.2
- II klasa bezpieczeństwa (wg EN-12469:2000)
- wyposażone w 2 filtry HEPA H14 (wlotowy/wylotowy)
- blat roboczy o szerokości 120 cm ze stali nierdzewnej
- sterowana elektrycznie szyba frontowa
- dwie pary świetlówek UV-C ustawionych pionowo dla pełnej dezynfekcji powierzchni roboczej
- tryb „standby” przy zamkniętej szybie – zredukowany przepływ powietrza utrzymuje komorę w gotowości do pracy
- kontrola ciśnienia powietrza w komorze zapewnia bezpieczeństwo pracy
Inkubatory CO2 Thermo Scientific Forma II z płaszczem wodnym
- objętość komory 184 L. Komora i półki wykonane ze stali nierdzewnej
- płaszcz wodny wokół komory zapewnia wysoką stabilność temperatury
- wyposażone w sondę CO2 typy TC lub IR, z funkcją autokalibracji
- podgrzewane szklane drzwi wewnętrzne w celu zminimalizowania kondensacji
- wentylator komory z filtracją powietrza cyrkulowanego (HEPA, ISO class 5)
- taca na wodę dla utrzymania odpowiedniego poziomu wilgotności w komorze
Wirówka laboratoryjna Hettich Rotina 380R
- wyposażona w system termostatowania komory. Zakres temperatur: od -20°C do +40°C
- rotor kątowy 45° 6×50/15 mL. Maksymalna prędkość 10 000 rpm
- rotor kątowy 45°5/2.0 mL. Maksymalna prędkość 15 000 rpm
- rotor wychylny dla próbówek 15/50 mL. Maksymalna prędkość 5 000 rpm
Wirówka laboratoryjna Hettich mikro 200
- wyposażona w rotor mikrolitrowy kątowy 45° 24×1.5/2.0 mL. Maksymalna prędkość 18 000 rpm
Mikroskop odwrócony Delta Optical IB100
- możliwość obserwacji w jasnym polu (BF) i kontraście fazowym (Ph)
- uchwyt preparatów z regulacją -X – Y
- uchwyt Terasaki i szalek Petriego/szkiełek podstawowych
- okulary stałoogniskowe 10x z regulacją dioptrii (+/-5)
- obiektywy planachromatyczne 4x, 10x, 20x, 40x
- oświetlacz LED z regulacją jasności
- nasadka trinokularowa umożliwiająca montaż aparatu/kamery (adapter 32 mm lub adapter c-mount)
Systemy do aspiracji pożywek
- proste i wydajne usuwanie zużytych mediów i odczynników
- wyposażone w uchwyty pozwalające na montaż końcówek do pipet oraz systemów wielokanałowych
