Oferta pracowni
Laboratorium Cytometrii
Laboratorium znajduje zastosowanie głównie w dziedzinie biotechnologii medycznej i badaniach nad komórkami ssaków, a także w ocenie wpływu nowych leków i farmaceutyków na pojedyncze komórki w warunkach in vitro:
- sortowanie populacji komórek o pożądanych cechach, w tym sortowanie komórek barwionych barwnikami fluorescencyjnymi (FACS)
- analiza populacji komórek pod względem występowania określonych czynników, np. wprowadzonego białka fluorescencyjnego, markerów powierzchniowych, zawartości DNA
- określanie wielkości, granulacji i kształtu komórek zwierzęcych i innych
Laboratorium Bioobrazowania
Laboratorium znajduje szerokie zastosowanie w biologii komórkowej, biotechnologii, medycynie regeneracyjnej oraz farmakologii. Wykorzystywane jest do badania procesów molekularnych i morfologicznych w komórkach i tkankach. Techniki bioobrazowania wspierają rozwój nowych terapii, badania nad nowymi biomateriałami oraz analizę odpowiedzi komórkowych na leki w badaniach in vitro. Zakres badań Laboratorium Bioobrazowania obejmuje:
- analizę struktur komórkowych i tkankowych przy użyciu zaawansowanych technik mikroskopowych
- obrazowanie fluorescencyjne żywych komórek i tkanek w czasie rzeczywistym
- badanie dynamiki procesów biologicznych oraz interakcji międzykomórkowych
- monitorowanie odpowiedzi komórek na bodźce zewnętrzne, analizę lokalizacji i aktywności białek
- badanie struktur subkomórkowych
Laboratorium Biologii Molekularnej
Badania realizowane w ramach Laboratorium znajdują zastosowanie w obszarze biotechnologii medycznej i tworzeniu nowych białek terapeutycznych, ale także w innych dziedzinach jak ochrona środowiska czy przemysł przetwórczy oparty o wykorzystanie mikroorganizmów:
- badanie i izolacja genów kodujących pożądane cechy
- opracowywanie systemów wprowadzania nowych genów do komórek
- tworzenie nowych szczepów bakteryjnych i kultur komórkowych produkujących cenne białka i peptydy
- optymalizacja i zwiększanie wydajności produkcji białek
Laboratorium Hodowli Komórek i Tkanek
Laboratorium Hodowli Komórek i Tkanek jest wyposażone w infrastrukturę pozwalającą na sterylną pracę z szerokim spektrum kultur komórkowych i tkankowych in vitro, w tym:
- prowadzenie hodowli kultur komórek zwierzęcych i ludzkich, w tym komórek macierzystych
- bieżące utrzymanie w hodowli linii komórek adherentnych i suspensyjnych, linii komórek ludzkich, zwierzęcych i zmodyfikowanych genetycznie (GMO).
- izolacja i hodowla komórek zwierzęcych
- transfekcja komórek
- badania nad działaniem hormonów, enzymów, nanocząstek i środków chemicznych in vitro
- badanie i produkcja przeciwciał, w tym przeciwciał monoklonalnych
- badanie i produkcja białek i peptydów
- badanie cytotoksyczności
Badania realizowane w Laboratorium znajdują szerokie zastosowanie w obszarze badań medycznych, badań przedklinicznych i biotechnologii medycznej, a także w przemyśle medycznym i diagnostyce.
Opiekunowie pracowni
dr Kamil Szeliski
kamil.szeliski@amu.edu.pl
dr Jagoda Litowczenko-Cybulska
jagoda.litowczenko@amu.edu.pl
Dostępna Aparatura
Cytometr przepływowy z sorterem SONY MA900
- wyposażony w 4 lasery wzbudzające: 405 nm, 488 nm, 561 nm i 638 nm w systemie 2 kolinearnym (488 nm + 561 nm, 405 nm + 638 nm)
- detekcja do 12 kanałów fluorescencyjnych oraz sygnałów z detektorów SSC i FSC w jednej analizie
- sortowanie 2- lub 4-drogowe do probówek (15 ml – 2-way / 5 ml – 4-way), na płytki wielodołkowe i płytki PCR
- szybkość sortowania do 12 000 eps (events per second, dla dyszy 70 µm)
- podawanie próbek z probówek 0.5 mL, 1.5 mL, 5 mL i 15 mL
- termostatowanie prób (5 – 37°C) i automatyczne mieszanie (300 rpm)
- wymienne, jednorazowe chipy sortujące o średnicy dyszy 70 µm, 100 µm i 130 µm (130 µm po wcześniejszych ustaleniach)
Cytometr przepływowy z sorterem Bio-Rad S3
- wyposażony w 2 lasery wzbudzające: 488 nm i 561 nm (100 mW)
- 4 detektory fluorescencji z PMT, detektory forward scatter (FSC) i side scatter (SSC)
- sortowanie 2 – drogowe do probówek 1.5 mL, 5 mL oraz na szkiełka podstawowe i probówki do PCR (8 – well strips)
- szybkość analizy do 100 000 eps (events per second), szybkość sortowania do 30 000 eps
- termostatowana komora próbki i komora sortująca (4 – 37°C)
- średnica dyszy 100 µm
Fluorescencyjny mikroskop biologiczny Olympus BX53
- metody obserwacji preparatów: jasne pole, ciemne pole, kontrast fazowy, światło spolaryzowane, fluorescencja
- filtry fluorescencyjne:
U-FUN (Ex 360-370 nm/Em 420 nm – DAPI, Alexa 350, 405, Hoechst 33258)
U-FVN (Ex 400-410 nm/Em 460 nm – ERTracker Blue-White)
U-FBN (Ex 470-495 nm/Em 510 nm –Alexa Fluor 488, Rhodamine 123)
U-FGNA (Ex 540-550 nm/Em 570 nm – TRITC, Rhodamine)
- oświetlacz Koehlera z lampą halogenową o dużej mocy
- źródło światła do fluorescencji – lampa rtęciowa
- kamera cyfrowa wraz z oprogramowaniem do analizy obrazów mikroskopowych Olympus cellSens
- okular 10x z regulacją dioptrii
- obiektywy 10x, 20x, 40x, 60x, 100x
Fluorescencyjny mikroskop biologiczny w układzie odwróconym Olympus IX73
- metody obserwacji preparatów: jasne pole, kontrast fazowy, fluorescencja
- filtry fluorescencyjne:
U-FUW (Ex 340-390 nm/Em 420 nm – DAPI, Alexa 350, 405, Hoechst 33258)
U-FBW (Ex 460-495 nm/Em 510 nm – Alexa Fluor 488, Rhodamine 123)
U-FGWA (Ex 530-550 nm/Em 570 nm –TRITC, Rhodamine –phalloidin)
U-FGW (Ex 530-550 nm/Em 575 nm – Cy3, Alexa 546, 555, 568, Propidium iodide (PI), Phycoerythrin, resorufin, TRITC)
- źródło światła do fluorescencji – lampa rtęciowa
- kamera cyfrowa wraz z oprogramowaniem do analizy obrazów mikroskopowych Olympus cellSens
- okular 10x z regulacją dioptrii
- obiektywy 4x, 10x, 20x, 40x, 60x
Mikroskop stereoskopowy Olympus SZX10
- głowica trinokularowa z kamerą cyfrową i oprogramowaniem Olympus cellsens
- oświetlacz halogenowy z ruchomym źródłem światła (światłowody) – obserwacja w świetle odbitym
- okular 10x
- obiektywy 0.5x, 1.0x, 2.0x
- zoom 0.63-6.3x
Mikroskop konfokalny Olympus FV1200 (oparty na odwróconym mikroskopie IX83)
Nowoczesny system skaningowego mikroskopu konfokalnego umożliwiający prowadzenie zaawansowanych badań biologicznych i materiałowych, zarówno na preparatach żywych, jak i utrwalonych:
- Wielodetekcyjna obserwacja preparatów żywych i utrwalonych.
- Zmotoryzowany stolik przedmiotowy XYZ umożliwiający precyzyjne pozycjonowanie próbek.
- Kompensacja dryfu termicznego w osi Z, dzięki czemu długotrwałe obserwacje są stabilne i powtarzalne.
- System kompensacji ostrości (Perfect Focus System – PFS) do automatycznej korekty zmian ogniskowania podczas długich pomiarów.
- Skanowanie różnych obszarów ROI – m.in. dla technik FRAP, FLIP, FRET i fotopobudzeń.
- Szybkość skanowania do 4 ramek/sekundę (512 x 512 px).
- Możliwość uzyskania obrazów do 2048 x 2048 px, w 12-bitowej skali szarości.
Źródła wzbudzenia (lasery):
- 405 nm (25 mW, dioda fioletowa),
- 458/473/488/515 nm (niebieskie, zielone),
- 559 nm (zielony DPSS),
- 635 nm (czerwony diodowy, 25 mW).
Detektory:
- Dwa detektory GaAsP o wysokiej czułości – idealne do słabych sygnałów fluorescencyjnych.
- Trzy detektory PMT z możliwością regulacji pasma detekcji dzięki systemowi galvo.
- Możliwość równoczesnej detekcji do 5 kanałów fluorescencji.
- Opcjonalny detektor światła transmitowanego.
Tryby obrazowania i eksperymenty specjalne:
- Zobrazowania 3D (w osi XYZ) z wysoką gęstością danych.
- Skanowanie liniowe, punktowe, lambda (widmowe), czasowe (xyzt).
- FRAP, FLIP, FRET – umożliwione dzięki precyzyjnemu wybieraniu ROI i modulacji wiązki.
- Techniki korelacyjne: FCS, FCCS, RICS.
- Rejestracja zmian fluorescencji w czasie (time-lapse imaging).
Obiektywy mikroskopowe (UPLSAPO):
- Obiektywy silikonowe i wodne (immersyjne) zapewniające głębokie obrazowanie w grubszych tkankach.
- 10x / NA 0.40
- 20x / NA 0.75
- 40x / NA 1.05 (immersja silikonowa)
- 60x / NA 1.3 i 1.4 (immersja silikonowa i olejowa)
